Thuốc viên: người lớn, trẻ ≥12 tuổi: triệu chứng GERD: 20 mg/ngày trong 2-8 tuần (khi triệu chứng đã giảm, kiểm soát tái phát bằng 20 mg/ngày nếu cần),
điều trị kiểm soát kéo dài và phòng ngừa cơn tái phát viêm thực quản trào ngược: 20 mg/ngày, tăng 40 mg/ngày nếu tái phát (khi đã kiểm soát được triệu chứng của cơn tái phát: giảm lại 20mg),
viêm thực quản trào ngược: 40 mg/ngày (có thể gấp đôi liều, nhất là khi không có đáp ứng với điều trị khác) trong 4-8 tuần;
người lớn: ngăn ngừa loét dạ dày tá tràng do NSAID: 20 mg/ngày,
diệt H. pylori: [40mg pantoprazole + 1000mg amoxicillin + 250-500mg clarithromycin] x 2 lần/ngày hoặc [40mg pantoprazole + 500mg metronidazole + 500mg clarithromycin] x 2 lần/ngày hoặc [40mg pantoprazole + 1000mg amoxicillin + 500mg metronidazole] x 2 lần/ngày (uống viên Pantoloc thứ hai trước bữa tối một giờ) trong 7 ngày đến tối đa 2 tuần (để đảm bảo chữa lành vết loét, có thể kéo dài thời gian điều trị, cân nhắc liều khuyến cáo cho loét tá tràng và loét dạ dày),
loét dạ dày/tá tràng: 40 mg/ngày (có thể gấp đôi liều, nhất là khi không có đáp ứng với điều trị khác) trong 4-8 tuần (loét dạ dày) hoặc 2-4 tuần (loét tá tràng),
điều trị hội chứng Zollinger-Ellison và tình trạng tăng bài tiết bệnh lý: bắt đầu 80 mg/ngày sau đó tăng hoặc giảm liều theo yêu cầu điều trị bằng cách đo nồng độ acid dịch vị bài tiết để định hướng, liều >80 mg/ngày chia 2 lần, có thể tăng tạm thời trên 160 mg/ngày song không điều trị kéo dài hơn thời gian cần thiết đủ để acid dạ dày được điều chỉnh.
Thuốc tiêm: loét dạ dày tá tràng, viêm thực quản trào ngược: 40 mg/ngày;
điều trị duy trì hội chứng Zollinger-Ellison và tăng bài tiết bệnh lý: bắt đầu 80 mg/ngày, sau đó tăng hoặc giảm liều theo yêu cầu điều trị thông qua xác định nồng độ acid gastric bài tiết, liều >80 mg/ngày có thể chia 2 lần, có thể tạm chỉnh lên 160 mg/ngày song không nên kéo dài hơn thời gian cần thiết để cân bằng nồng độ acid dạ dày, nếu cần điều chỉnh nồng độ acid dạ dày cấp: bắt đầu 2 x 80 mg để kiểm soát việc giảm sản sinh acid trong khoảng cho phép (<10 mili đương lượng/giờ) trong vòng 1 giờ;
phòng ngừa tái xuất huyết do loét dạ dày/tá tràng: tiêm IV chậm 80 mg, sau đó truyền tiếp 8 mg/giờ trong 72 giờ.
Bệnh nhân suy gan nặng: không quá 20 mg/ngày. Không khuyến cáo dùng ở người <18 tuổi (thuốc tiêm), <12 tuổi (thuốc viên).